生物性污染

土壤的生物性污染仍然是当前土壤污染的重要危害，影响面广。人体排出的含有病原体的粪便污染土壤，人生吃在这种土壤中种植的蔬菜瓜果等而感染得病(人-土壤-人)。含有病原体的动物粪便污染土壤后，病原体通过皮肤或粘膜进入人体而得病(动物-土壤-人)。天然土壤中常含有破伤风杆菌和肉毒杆菌，人接触土壤而感染(土壤-人)。

农药污染

即使土壤中农药的残留浓度是很低的，但通过食物链和生物浓缩可使生物体内浓度提高至几千倍，甚至几万倍。而且农药污染后，主要通过饮食进入机体，产生各种危害。

由于不正确的使用农药、误服及自杀等而引起急性农药中毒，而长期接触农药可以引起慢性中毒。报道最多的是有机氯和有机磷农药慢性中毒。另外，农药还具有致突变、致癌和致畸作用。

持久性有机污染物

持久性有机污染物是一类全球环境和人类健康影响非常巨大的化学物质，已经引起全世界的广泛关注。它可通过多种途径进入机体，在体内的脂肪组织、肝脏等器官组织及胚胎中积聚，产生毒性。动物实验表明，持久性有机污染物可对包括肝、肾等脏器及神经系统、内分泌系统、生殖系统免疫系统等产生急性和慢性毒性，并具有明显的致癌、致畸、致突变等作用。

重金属污染

痛痛病就是由于含镉废水污染农田而引起的公害病。患者全身疼痛，终日喊疼不止，故名痛痛病(亦称骨痛病)。土壤铊污染通过冶炼和工业生产的废水、废气、废渣污染土壤而引起居民中毒。土壤受铬污染对健康的危害主要是六价铬。土壤铬污染主要来自铬矿和金属冶炼、电镀、制革等工业废水、废气、废渣。六价铬易溶于水，所以容易经过土壤进入农作物而危害居民健康。